医药学院为云南科技信息职业学院的重点二级学院，由始建于2003年的药学系发展而来。先后为社会培养了三千余名药学专业人才。学院现开设药品生产技术、药品经营与管理专业、药学专业。

二十多年来学院不断加强师资队伍建设。如今，学院已拥有一批由高级技术职称专家带领的结构合理的师资及管理团队，能全面满足学院各专业教育教学发展所需。

学校高度重视医药学院实验、实训建设，充分利用各种合作机制，资源共享，搭建了能满足各专业教学的中草药标本室、中药炮制室、化学实验室、制剂实验室、药理实验室、中药调剂室、现场教学基地等校内外实验、实训平台。课堂教学全部采用多媒体教学，效果良好。学院办学特色鲜明，成为培养药学及药学相关专业人才的重要基地。

医药学院先后与多家药业公司、制药厂、医院和医药连锁店建立了良好的校企合作关系。组织学生到企业参观学习，邀请企业技术专家到学校讲课，组织召开企业与学校供需双方参加的实习就业双选会，把学生实习与就业结合起来，创造了良好的实习与就业环境。医药学院严谨的治学态度、良好的学习氛围、畅通的成长渠道多次受到了学校的表彰和奖励。

学生可获取的职业资格证书：执业药师（发证单位：云南省人力资源和社会保障厅）、医药商品购销员、中药调剂员、药物制剂工、保健按摩师、药房辅助人员等国家认可的技能等级证书。